抗生素是某些微生物通过酶促反应将初级代谢物转变为结构性细菌素的次级代谢物细菌素，诸如短杆菌肽S等，通过酶促反应把氨基酸转变为结构复杂的化合物，而Nisin等细菌素则需要通过核糖体来合成，从而是真正的蛋白类物质细菌素与抗生素的根本差别是大部分细菌素只对近缘关系的细菌有损害作用，且具有无毒无副作用。
不属于植物杀菌素又称“植物杀生素”，是高等植物组织内产生的能杀死或抑制微生物生长的物质，细菌素是某些细菌在代谢过程中通过核糖体合成机制产生的一类具有抑菌活性的多肽或前体多肽，细菌素不是植物组织内产生的，不属于植物杀菌素。
1细菌素以生产菌而命名 如大肠杆菌产生的细菌素称大肠杆菌素，乳酸菌产生的称为乳酸链球菌素乳链菌肽，Nisin，绿脓杆菌产生的称绿脓杆菌素2细菌素根据化学结构稳定性和分子量大小可分为4类第一类定义为羊毛硫抗生素Lantibiotics，是一类小分子的修饰肽，含1950个以上的氨基酸分子。
细菌素可以抑制许多革兰氏阳性菌，如Nisin抑制葡萄菌属链球菌属小球菌属和乳杆菌属的某些菌种，抑制大部分梭菌属和芽孢杆菌属的孢子嗜酸乳杆菌和发酵乳杆菌产生的细菌素对乳杆菌片球菌明串球菌乳球菌和嗜热链球菌但有研究发现，Nisin与螯合剂如EDTA连接后，改变细菌素了细胞的渗透性，可以抑制。
产生机制不同，作用机制不同1产生机制不同产细菌素是细菌产生的一种抗菌物质，而毒性质粒是含有毒素蛋白基因的质粒，可编码产生细菌毒素蛋白的基因2作用机制不同产细菌素的主要作用是抑制或杀灭细菌，而毒性质粒的作用主要是通过编码产生细菌毒素蛋白来对宿主细胞产生毒性作用。
